Nacido Giovanni di Niccolò Mansueti, este pintor estudió en Venecia con Gentile Bellini (1429-1507), uno de los miembros de la famosa familia de pintores. Al igual que su maestro, Mansueti pintó con gran cuidado y detalles elaborados. Sus trabajos muestran también la influencia de Conegliano (1459-1517) y de otro alumno de Bellini, Vittore Carpaccio (1460-1526). Como este último, Mansueti tuvo una notable habilidad en la representación de la ropa ornamentales y detalles precisos de interiores.
Su primera obra documentada se remonta a 1492, y se titula Representación simbólica de la Crucifixión.Sus obras para la Escuela Grande de san Giovanni Evangelista, en Venecia, son buen ejemplo de su estilo compositivo elaborado. Son parte del ciclo de frescos Milagros de la Cruz, que incluye La curación milagrosa de la hija de Benvegnudo de san Polo y El milagro de la Cruz en campo san Lio.
Sus obras están expuestas en museos de todo el mundo, incluyendo los Uffizi, donde se encuentra el Cristo entre los Sabios.